Государственная лицензия на изыскательскую деятельность
Государственная лицензия на проектную деятельность
Государственная лицензия на строительно-монтажные работы
Государственная лицензия на деятельность по производству геодезических и картографических работ
Государственная лицензия на эксплуатацию горных и химических производств
С 2004 года в НПЦ «ГЕОКЕН» внедрена и успешно функционирует интегрированная система менеджмента качества, экологического менеджмента, менеджмента профессиональной безопасности и здоровья на соответствие ISO 9001:2008, СТ РК ИСО 9001-2009; ISO 14001: 2004, СТ РК 14001: 2006; и OHSAS 18001:2007, СТ РК OHSAS 18001-2008.
В январе 2023 г. ежегодный инспекционный контроль в НПЦ «ГЕОКЕН» подтвердил соответствие системы менеджмента профессиональной безопасности и здоровья требованиям стандартов OHSAS 18001:2007, СТ РК OHSAS 18001-2008 и соответствие менеджмента качества, экологического менеджмента требованиям новым версиям международных стандартов ISO 9001:2015, 14001: 2015 и стандартов Республики Казахстан СТ РК ИСО 9001-2016, СТ РК ИСО 14001-2016.